2009年8月，某乡蔬菜公司经县土地管理局批准，临时征用10亩土地修建仓库，后因故未建。2013年９月，蔬菜公司与县木材公司达成协议，共建职工住宅五幢，蔬菜公司提供原征用的１0亩土地，交出资总额的五分之一，其余所需资金由木材公司提供。之后，双方与县第二建筑公司签订了建筑承包合同，并向县城建办领取了施工执照。当县第二建筑公司完成设计，进入工地并开始施工时，木材公司尚未依约将第一期工程款汇出。县第二建筑公司拟停工等款。为避免日后引起纠纷，遂向县律师事务所赵律师询问这样处理是否妥当。赵律师听取县第二建筑公司介绍的情况，并查阅了有关法律规定后，认为该工程存在问题较多，应当停止施工，解除合同，并向蔬菜公司和木材公司要求赔偿损失。问： （1）该工程存在哪些法律问题?依据是什么? （2）此事应当如何处理?
2000年7月某承包公司与某房地产公司就某项目签订了一份前期工程协议书，双方约定：承包公司负责该项目的前期工程，包括动迁和七通一平，房地产公司按完成面积分四期支付工程款。 在合同履行过程中，承包公司由于疏忽，对在项目基地红线边缘的两所约定应拆除的民房未予以拆除。房地产公司虽然知道这种情况，但一直不予提醒，而且不加以说明地拒付大部分工程款，为此工程延误一段工期，这种状况一直延续到工程完工。结算过程中，承包公司根据协议要求房地产公司支付尚未支付的2000万元的工程款，但遭到房地产公司的拒绝。理由是，承包公司没有按协议完成任务，两所民房仍未拆除且拖延工期。2001年4月，承包公司以欠款为由将房地产公司告上法庭。 问题：该项目合同履行中在哪些方面不符合《建筑法》与《合同法》的有关事宜？法院应如何做出判决。